Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Pcsk9Q80W65 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Pcsk9Q80W65 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Pcsk9Q80W65 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Pcsk9Q80W65 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
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Pcsk9Q80W65 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pcsk9Q80W65 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pcsk9Q80W65 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms