Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2q1Q7TSS2 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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