Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSI3

Ppp6r1, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp6r1Q7TSI3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gm8215-201ENSMUST00000120627 990 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Tmem212-201ENSMUST00000058077 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ppp6r1Q7TSI3 Scnm1-201ENSMUST00000172572 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ppp6r1Q7TSI3 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ppp6r1Q7TSI3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Vmn1r-ps19-201ENSMUST00000177008 926 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp6r1Q7TSI3 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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