Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Dsg1bQ7TSF1 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Dsg1bQ7TSF1 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Dsg1bQ7TSF1 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Dsg1bQ7TSF1 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Dsg1bQ7TSF1 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Dsg1bQ7TSF1 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Dsg1bQ7TSF1 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1bQ7TSF1 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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