Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.3 ms