Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shq1Q7TMX5 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms