Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ccdc88cQ6VGS5 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ccdc88cQ6VGS5 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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