Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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Zbtb40Q6PCS8 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Zbtb40Q6PCS8 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms