Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Smchd1Q6P5D8 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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