Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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