Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Pkp4Q68FH0 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Pkp4Q68FH0 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
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Pkp4Q68FH0 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Pkp4Q68FH0 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Pkp4Q68FH0 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Pkp4Q68FH0 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pkp4Q68FH0 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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