Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Kiaa1549Q68FD9 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms