Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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