Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Bcl2l11-205ENSMUST00000110341 5036 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Alms1-201ENSMUST00000072018 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Mlh3-202ENSMUST00000166821 5420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf2Q64705 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 214.8 ms