Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sdc3Q64519 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sdc3Q64519 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sdc3Q64519 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sdc3Q64519 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sdc3Q64519 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sdc3Q64519 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sdc3Q64519 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sdc3Q64519 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sdc3Q64519 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sdc3Q64519 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Sdc3Q64519 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sdc3Q64519 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sdc3Q64519 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Sdc3Q64519 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sdc3Q64519 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Sdc3Q64519 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sdc3Q64519 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Sdc3Q64519 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Sdc3Q64519 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Sdc3Q64519 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Sdc3Q64519 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Sdc3Q64519 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Sdc3Q64519 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sdc3Q64519 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sdc3Q64519 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Sdc3Q64519 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc3Q64519 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Sdc3Q64519 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc3Q64519 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc3Q64519 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc3Q64519 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc3Q64519 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc3Q64519 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc3Q64519 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc3Q64519 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sdc3Q64519 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
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