Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Glrx2-206ENSMUST00000145969 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Prmt1-214ENSMUST00000209124 741 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 AU015228-201ENSMUST00000121103 1320 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
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AtrxQ61687 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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AtrxQ61687 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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AtrxQ61687 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
AtrxQ61687 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms