Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klf3Q60980 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms