Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
JrkQ60976 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
JrkQ60976 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
JrkQ60976 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
JrkQ60976 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
JrkQ60976 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
JrkQ60976 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms