Protein–RNA interactions for Protein: Q60841

Reln, Reelin, mousemouse

Predictions only

Length 3,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelnQ60841 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 AC158777.1-201ENSMUST00000226216 1724 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Krtap6-3-202ENSMUST00000185581 520 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Rpl22l1-201ENSMUST00000043867 552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Krtap6-3-201ENSMUST00000079151 444 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Rian-208ENSMUST00000182370 352 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Tmem212-201ENSMUST00000058077 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Gm31378-201ENSMUST00000213538 267 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 AC192333.3-201ENSMUST00000224041 463 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Ntf3-203ENSMUST00000204542 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RelnQ60841 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms