Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms