Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Tdrd5Q5VCS6 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
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Tdrd5Q5VCS6 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Tdrd5Q5VCS6 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Tdrd5Q5VCS6 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Tdrd5Q5VCS6 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tdrd5Q5VCS6 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.3 ms