Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms