Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Trim58Q5NCC9 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Trim58Q5NCC9 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Trim58Q5NCC9 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Trim58Q5NCC9 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Trim58Q5NCC9 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Trim58Q5NCC9 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Trim58Q5NCC9 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Trim58Q5NCC9 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Trim58Q5NCC9 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Trim58Q5NCC9 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Trim58Q5NCC9 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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