Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm28047Q3US59 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Gm28047Q3US59 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Gm28047Q3US59 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Gm28047Q3US59 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Gm28047Q3US59 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Gm28047Q3US59 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Gm28047Q3US59 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Gm28047Q3US59 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Gm28047Q3US59 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28047Q3US59 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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