Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gm37676-201ENSMUST00000195496 507 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 4930595O18Rik-201ENSMUST00000205099 607 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Fxr1-202ENSMUST00000167354 1986 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gm5605-201ENSMUST00000208940 1305 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gm12656-201ENSMUST00000118149 577 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gm14024-201ENSMUST00000141964 560 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gm20407-201ENSMUST00000172891 598 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gm36966-201ENSMUST00000192217 413 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Rps25-201ENSMUST00000080300 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf48Q3US17 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms