Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acsf3Q3URE1 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms