Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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D13Ertd608eQ3UPR8 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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D13Ertd608eQ3UPR8 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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D13Ertd608eQ3UPR8 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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D13Ertd608eQ3UPR8 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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D13Ertd608eQ3UPR8 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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D13Ertd608eQ3UPR8 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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D13Ertd608eQ3UPR8 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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