Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Tmem253Q3UNB8 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Tmem253Q3UNB8 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Tmem253Q3UNB8 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Tmem253Q3UNB8 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms