Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf40Q3U319 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Rnf40Q3U319 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf40Q3U319 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf40Q3U319 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf40Q3U319 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf40Q3U319 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf40Q3U319 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Rnf40Q3U319 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Rnf40Q3U319 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Rnf40Q3U319 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf40Q3U319 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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