Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.7 ms