Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms