Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fndc4Q3TR08 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
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