Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Trappc13Q3TIR1 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
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Trappc13Q3TIR1 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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