Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms