Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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