Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms