Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

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Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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