Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Ttc39dQ0VF76 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Ttc39dQ0VF76 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Ttc39dQ0VF76 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Ttc39dQ0VF76 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms