Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Diablo-207ENSMUST00000145152 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab42Q0PD08 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms