Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms