Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MitfQ08874 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MitfQ08874 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MitfQ08874 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MitfQ08874 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MitfQ08874 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MitfQ08874 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
MitfQ08874 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MitfQ08874 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
MitfQ08874 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.4 ms