Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms