Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Pomgnt1-204ENSMUST00000120083 2953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdf3Q07104 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms