Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms