Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NfiaQ02780 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms