Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms