Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mc1rQ01727 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms