Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Top2aQ01320 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms