Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms