Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms